Pozytywne działania protistów :
Biologiczne oczyszczanie wód,
- Stosuje się je jako nawóz, przez to służą do użyźniania gleb,
- Wytwarzany kwas alginowy przez brunatnice stosowany w przemyśle tekstylowym jako impregnator,
- Protisty to cenne składniki wody i soli mineralnych,
- Stosowane są także w medycynie i farmaceutyce (np. kremy)
Negatywne działania protistów;
- Zakwity wód, co przyczynia się do śmierci wielu organizmów wodnych,
- Biorą udział w tworzeniu skorupy ziemskiej, pancerzyki otwornic tworzą pokłady mułów na dnie oceanicznym, które po latach przekształcają się w skały wapienne,
- Oczyszczają wody i ścieki z bakterii.
