Bakterie w przyrodzie pełnią funkcje zarówno negatywne jak i pozytywne . Niebezpieczne są bakterie chorobotwórcze , które wywołują np :cholerę , dżumę , gruźlice , tyfus , Kiłe
Choroby bakteryjne roślin np:
-narośla
-więdnięcie
-Zgnilizny, nekrozy i plamistości
Bakterie negatywnie wpływają na żywność , materiały ,artykuły ponieważ powodują procesy rozkładu (gnicia)
Pozytywną funkcję pełnia bakterie fermentacyjne
-do produkcji octu , alkoholu ,
-pasz
-Do produkcji niektórych witamin np. B12 i C
-Do produkcji antybiotyków np. streptomycyny