Pośrednie dowody ewolucji to analiza różnić i podobieństw występujących między organizmami. Przykłady pośredniej ewolucji to: kończyny kręgowców (skrzydło ptaka, płetwa wieloryba, ręka człowieka) i łodyg (bulwa ziemniaka i kłącze imbiru).
Bezpośrednie dowody ewolucji to śledzenie kolejności pojawienia się form organizmów. Przykłady bezpośredniej ewolucji to: skamieniałości i relikty.
